L’étude des variants génétique permettant d’expliquer des traits de caractères spécifiques se faisait à ce jour variant par variant. Or c’est souvent leurs combinaisons qui a de l’intérêt. Dans un article publié dans la revue Genome Biology, les scientifiques décrivent une méthode mêlant mathématique, génétique et calcul haute performance pour créer des cartes d’interactions exhaustives rassemblant plusieurs dizaines de milliards d’interaction entre variants génétiques et permettant d’étudier ces combinaisons. [Lire la suite du communiqué du CNRS]

Contact : Gabriel Kouk, équipe SYSTEMS

Carré C*✉, Carluer J-B*, Chaux C, Estoup-Streiff C, Roche N, Hosy E, Mas A✉, Krouk G✉ (2024) Next-Gen GWAS: full 2D epistatic interaction maps retrieve part of missing heritability and improve phenotypic prediction. Genome Biol., 25:76

On en parle :

• Comment les mathématiques permettent d’identifier des prédispositions à certaines maladies : une première mondiale, La Tribune Occitanie-Montpellier (25 mars 2024)
• Podcast de l’émission « A l’UM la science » du 15 mai 2024