Léo Larraz
Team : Influx – IPSiM
Supervisor : Alexis De Angeli
Title : New genetically encoded biosensors for measuring ion concentrations in subcellular compartments of plant cells
Abstract : Understanding the molecular mechanisms that regulate stomatal opening and closing is a significant question in plant biology. The opening and closing of stomata depend on the movement of solutes between the extracellular space and the cell. Within the cell, the vacuole and the cytosol are the two compartments that undergo the most significant changes in ion accumulation during stomatal movements. Despite their importance, the molecular mechanisms regulating ion fluxes across the two membranes delineating the vacuole and the cytosol remain largely unknown. In this context, the thesis has two main objectives : 1) To understand and visualize (in vivo) the molecular mechanisms that activate ion transporters during stomatal opening and closing. 2) To generate and develop new genetically encoded biosensors to quantify key anion concentrations (Cl– and NO3–) in the cytosol and the vacuole.
Coralie Masson
Team : AQUA – IPSiM
Supervisor : Yann Boursiac
Title : Water stress perception in plants: mechanisms underlying quantitative transcriptional responses to turgor and osmotic potential
Abstract : The overall objective of my PhD is to better understand how changes in physicochemical parameters induced by water stress are translated into biological responses by plants.
The first aspect focuses on the mechanisms regulating ENODL8 mRNA abundance under moderate water deficit conditions, with a particular emphasis on a potential regulation through molecular condensates.
The second axis aims at identifying cis-regulatory elements in the promoter and 3’UTR regions of the NCED3 gene. Expression of this gene is induced in response to water stress and this feature was employed to create a hydraulic-reporter. Finally, I will explore if cell hydraulic parameters are truly at the origin of the perception of a water deficit.
Wu Die
Team: ETAP-LEPSE
Supervisors: Laurent Torregrosa, Anne Pellegrino
Title: Physiological and Transcriptional Determinism of the LowSugarBerry Trait and its Impacts on the Performance of the Vine under Soil-Air Water Deficits.
Abstract: Les nouvelles variétés de vigne à faible chargement en sucres dans les baies (LowSugarBerry, LSB) et résistantes aux maladies fongiques de la vigne pourraient conférer une plus forte résilience des vignobles face aux changements climatiques et aux injonctions sociétales de réduction durecours aux intrants. Toutefois, une meilleure connaissance des propriétés d’acclimatation de ces variétés en termes de gestion de l’eau et du carbone sous contrainte hydrique est nécessaire. L’objectif de cette thèse sera d’une part de comparer les réponses du métabolisme carboné et du bilan hydrique entre des variétés de vigne LSB et non LSB soumises à différents niveaux de déficits hydriques du sol et/ou de l’air et d’autre part de disséquer l’origine du trait LSB par des analyses fines de la structure et de la composition des tissus des baies. Pour ce faire, différentes méthodes de phénotypage seront déployées sur vigne et microvigne (LSB, non LSB), au champ et en conditions contrôlées (serre, chambre de culture) pour évaluer (i) le fonctionnement des photosystèmes et les flux de transpiration des organes (feuille, fruit) et de la plante entière, et (ii) la rhéologie des baies en lien avec la composition des parois cellulaires de la pellicule et de la pulpe des baies. Des échantillons de baies seront récoltés lors des expérimentations pour une analyse transcriptomique ultérieure visant à identifier les gènes associés au caractère LSB. Ce projet permettra in fine d’acquérir de nouvelles connaissances en vue du déploiement des variétés LSB ainsi que pour la sélection de nouvelles variétés portant le caractère LSB.
The Dan Pham
Team : Honude – IPSiM
Supervisors : Benoit LACOMBE and Francois BARBIER.
Title : Study of interactions between nitrate and strigolactones in plants.
Abstract : Strigolactones are a group of recently discovered phytohormones with various roles such as branching, root development, symbiosis with arbuscular mycorrhiza and parasitism. Currently, I am investigating whether nitrogen transport could affect strigolactone biosynthesis in Arabidopsis. This link is supported by the latest findings, but its molecular nature remains completely uncharacterized. In order to investigate this question, I will use techniques such as branch phenotyping, grafting, and yeast 1-hybrid assay with a variety of mutants, as well as in silico analyses of pre-existing relevant data.