Atelier de Quantifications Isotopiques (AQuI)
L’Atelier de Quantification Isotopiques (AQUI), hébergé par l’Institut des Sciences des Plantes de Montpellier (IPSiM), a été créé en 1990 afin de fournir un service national d’analyse de l’azote au sein de l’INRAE. Depuis, ses missions ont considérablement évolué. Il assure aujourd’hui l’analyse des teneurs isotopiques en ¹⁵N, ¹³C, ¹⁸O et ³⁴S non radioactifs, sur des échantillons provenant de nombreux laboratoires, non seulement de l’INRAE, mais également d’autres institutions de recherche publiques et privées, y compris à l’international.
L’Atelier a également pour mission de soutenir les programmes de recherche de l’UMR IPSiM, qui étudient les mécanismes de la nutrition azotée et carbonée des plantes, avec un accent particulier sur le transport et le métabolisme des composés azotés et carbonés.
Par ailleurs, l’Atelier a développé des approches de détection de molécules marquées dans des ovocytes de xénope, en collaboration avec la plateforme PEP de l’UMR. Ces approches ont permis de caractériser des transporteurs de nutriments et d’hormones végétales.
La plateforme AQUI propose désormais également des dosages de d’anions et de métabolites primaires (sucres, acides organiques) dans diverses matrices, telles que les tissus végétaux ou les sols.
Enfin, la plateforme AQUI poursuit ses développements avec la mise en place d’un système UHPLC-HRMS pour la quantification de métabolites, notamment des phytohormones. Elle continue également de développer des approches basées sur les traceurs isotopiques, en mettant en place des méthodes permettant de tracer le phosphate dans les plantes grâce au marquage isotopique de l’oxygène.
Modalités d'accès
Contact
Avant toute demande d’analyse, il est préférable de contacter Thibaut Perez au 04-99-61-25-18 ou par mail
Adresse postale : Thibaut Perez, Institut des Sciences des Plantes de Montpellier (IPSiM) – UMR CNRS/INRAE/Institut Agro/UM, Place Viala
34060 Montpellier Cedex France.
Tarifs
Pour obtenir un devis, téléchargez la fiche de demande, renseignez la et envoyez la à umr-ipsim-aqui@supagro.fr
Personnels / Organigramme
Expertise
Analyses et quantification directe :
• Mesure des teneurs en carbone (C), azote (N), soufre (S), hydrogène (H) et oxygène (O) dans des matrices végétales, animales, gazeuse et environnementales (sols, etc.).
• Mesure des isotopes stables associés à ces éléments : 13C/12C, 15N/14N, ³⁴S/32S, ²H/1H et ¹⁸O/16O.
• Mesure du ¹³C/12C dans les moûts de raisin et les acides nucléiques. • Détection et quantification de molécules marquées aux isotopes stables dans des ovocytes de xénope, en collaboration avec la plateforme PEP (mesure des transports après expression hétérologue de transporteurs membranaires).
• Dosage des anions, des acides organiques et des sucres dans des extraits de sols, de végétaux et d’échantillons animaux par chromatographie ionique (HPIC).
Matériels / Technologies
La plateforme AQUI est équipée de plusieurs systèmes analytiques :
• Vario Isotope Select (analyseur élémentaire) couplé à un Isoprime (spectromètre de masse à rapport isotopique) pour les éléments C, H, N et S.
• Vario Pyrocube (analyseur élémentaire) couplé à un Isoprime (spectromètre de masse à rapport isotopique) pour les éléments O et H. • Isoflow : passeur d’échantillons pour l’analyse des gaz.
• Dionex ICS 5000+ (chromatographie ionique, HPIC) avec détecteurs ampérométrique et conductimétrique.
• Vanquish UHPLC couplée à un Q Exactive Plus (HRMS).
Formations
La plateforme AQUI a participé à l’école thématique MISTRAL (Montpellier International School on Ion and Water Transport in Plants) en 2012, 2014, 2016, 2018 et 2022.
Elle participe également chaque année à une école thématique intégrée à une unité d’enseignement de l’Université de Montpellier, afin de former les étudiants à l’utilisation des isotopes stables dans leurs expérimentations.c
Actualités
Publications
Publications récentes ayant incorporé les résultats analytiques de l’Atelier :
Vasseur F✉, Cornet D, Beurier G, Messier J, Rouan L, Bresson J, Ecarnot M, Stahl M, Heumos S, Gerard M, Reijnen H, Tillard P, Lacombe B, Emanuel A, Floret J, Estarague A, Przybylska S, Sartori K, Gillespie LM, Baron E, Kazakou E, Vile D, Violle C (2022) A perspective on plant phenomics: coupling deep learning and near-infrared spectroscopy.. Front. Plant Sci., 13:836488
Rasoarinaivo AR✉, Razafimbelo TM, Blanchart E, Chapuis-Lardy L, Chevallier T, Bouillet J-P, Trap J (2022) Specific effects of tree species on soil carbon sequestration in a rice-tree association mesocosm experiment: Evidence from natural 13C abundance. Rhizosphere, 21:100485
Kupcsik L, Chiodi C, Moturu TR, De Gernier H, Haelterman L, Louvieaux J, Tillard P, Sturrock CJ, Bennett MJ, Nacry P, Hermans C✉ (2021) Oilseed rape cultivars show diversity of root morphologies with the potential for better capture of nitrogen. Nitrogen, 2(4):491-505
Couchoud M, Salon C, Girodet S, Jeudy C, Vernoud V*✉, Prudent M*✉ (2020) Pea efficiency of post-drought recovery relies on the strategy to fine-tune nitrogen nutrition. Front. Plant Sci., 11:204
Li Y, Brooks MD, Yeoh-Wang J, McCoy RM, Rock TM, Pasquino AV, Moon CI, Patrick RM, Tanurdzic M, Ruffel S, Widhalm JR, McCombie WR, Coruzzi GM✉ (2020) SDG8-mediated histone methylation and RNA processing function in the response to nitrate signaling. Plant Physiol., 182(1):215-227
Pichereaux C*, Laurent E-A*, Gargaros A, Viudes S, Durieu C, Lamaze T✉, Grieu P, Burlet-Schiltz O✉ (2019) Analysis of durum wheat proteome changes under marine and fungal biostimulant treatments using large-scale quantitative proteomics: A useful dataset of durum wheat proteins. J. Proteomics, 200:28-39
Merret R✉, Carpenier M-C, Favory J-J, Picart C, Descombin J, Bousquet-Antonelli C, Tillard P, Lejay L, Deragon J-M, Charng Y-Y✉ (2017) Heat-shock protein HSP101 affects the release of ribosomal protein mRNAs for recovery after heat shock. Plant Physiol., 174(2):1216-1225
Li G, Tillard P, Gojon A, Maurel C✉ (2016) Dual regulation of root hydraulic conductivity and plasma membrane aquaporins by plant nitrate accumulation and high-affinity nitrate transporter NRT2.1. Plant Cell Physiol., 57(4):733-742
Wahbi S, Maghraoui T, Hafidi M, Sanguin H, Oufdou K, Prin Y, Duponnois R, Galiana A✉ (2016) Enhanced transfer of biologically fixed N from faba bean to intercropped wheat through mycorrhizal symbiosis. Appl. Soil Ecol., 107:91-98
Léran S, Edel KH, Pervent M, Hashimoto K, Corratgé-Faillie C, Offenborn JN, Tillard P, Gojon A, Kudla J, Lacombe B✉ (2015) Nitrate sensing and uptake in Arabidopsis are enhanced by ABI2, a phosphatase inactivated by the stress hormone abscisic acid. Sci. Signal., 8(375):ra43
Léran S, Garg B, Boursiac Y, Corratgé-Faillie C, Brachet C, Tillard P, Gojon A, Lacombe B✉ (2015) AtNPF5.5, a nitrate transporter affecting nitrogen accumulation in Arabidopsis embryo. Sci. Rep.-UK, 5:7962
Léran S, Muños S, Brachet C, Tillard P, Gojon A, Lacombe B✉ (2013) Arabidopsis NRT1.1 is a bidirectional transporter involved in root-to-shoot nitrate translocation. Mol. Plant, 6(6):1984-1987
Vasseur F, Violle C, Enquist BJ, Granier C, Vile D (2012) A common genetic basis to the origin of the leaf economics spectrum and metabolic scaling allometry. Ecol. Lett., 15(10):1149-1157
Laguerre G, Heulin-Gotty K, Brunel B, Klonowska A, Le Quéré A, Tillard P, Prin Y, Cleyet-Marel J-C, Lepetit M (2012) Local and systemic N signaling are involved in Medicago truncatula preference for the most efficient Sinorhizobium symbiotic partners. New Phytol., 195(2):437-449
Laugier E, Bouguyon E, Mauriès A, Tillard P, Gojon A, Lejay L (2012) Regulation of high-affinity nitrate uptake in roots of Arabidopsis depends predominantly on post-transcriptional control of the NRT2.1/NAR2.1 transport system . Plant Physiol., 158(2):1067-1078
Kiba T, Feria-Bourrellier A-B, Lafouge F, Lezhneva L, Boutet-Mercey S, Orsel M, Bréhaut V, Miller AJ, Daniel-Vedele F, Sakakibara H, Krapp A (2012) The Arabidopsis nitrate transporter NRT2.4 plays a double role in roots and shoots of nitrogen-starved plants[. Plant Cell, 24(1):245-258
Qualité
L’AQuI est labellisé « fiabilité des mesures » de niveau 2 par le CT2M.
Accès restreint / réservé
