La plateforme d’histocytologie et imagerie cellulaire végétale (PHIV)
Pour comprendre le rôle des gènes et des protéines dans le fonctionnement intégré de l’organisme entier, il faut pouvoir localiser précisément leur site d’expression. Ceci est rendu possible par diverses techniques d’imagerie, qui permettent de visualiser directement l’activité des gènes et la présence des protéines dans chaque cellule de la plante.
L’IPSiM consacre des efforts importants pour développer ces techniques, notamment au travers de la Plateforme d’Histocytologie et d’Imagerie Végétale (PHIV), portée conjointement avec l’UMR AGAP. Cette plateforme est localisée sur deux sites : campus SupAgro-INRA (PHIV-La Gaillarde) pour l’IPSiM et campus CIRAD (PHIV-Lavalette) pour AGAP. PHIV est associée à la grande plateforme régionale MRI (www.mri.cnrs.fr, certification ISO9001 et NFX 50-900) et regroupe une équipe de techniciens, ingénieurs, et chercheurs mettant de nombreux matériels et compétences en imagerie de la plante au service des équipes de recherche (anatomie végétale, histocytologie, hybridation in situ, immunofluorescence, imagerie du vivant en microscopie photonique, confocale et de luminescence, imagerie spectrale, biosenseurs).
Réservation
Remerciements / Acknowledging
Dans les remerciements et/ou dans la rubrique Matériels et Méthodes, l’apport technique de la plateforme PHIV doit être souligné et mentionné clairement et les personnels directement impliquées, lorsqu’ils ne sont pas co-auteurs, peuvent être nommés.
Exemple pour PHIV : « We acknowledge the Histocytology and Plant Cell Imaging platform (PHIV) for technical support. »
Exemple pour MRI : “We acknowledge the imaging facility MRI, member of the national infrastructure France-BioImaging infrastructure supported by the French National Research Agency (ANR-10-INBS-04, «Investments for the future»)“
[ Remercier une plateforme BioCampus ]
In the acknowledgments and / or in the Materials and Methods section, the technical contribution of the PHIV platform must be underlined and clearly mentioned and the personnel directly involved, when they are not co-authors, can be named.
Example for PHIV: “We acknowledge the Histocytology and Plant Cell Imaging platform (PHIV) for technical support.”
Example for MRI: “We acknowledge the imaging facility MRI, member of the national infrastructure France-BioImaging infrastructure supported by the French National Research Agency (ANR-10-INBS-04, «Investments for the future»)“
[ Acknowledging core facilities ]
Procédure de récupération des données
Liste des ordinateurs :
| Adresses | Login | Mot de passe | Salle | Répertoire de dépôt | |
|---|---|---|---|---|---|
| Responsable : Carine Alcon | |||||
| PC : \\stocka2\bpmp‐adm‐scope1‐campus Mac : smb://stocka2/bpmp-adm-scope1-campus |
LDAP | LDAP | 127 | C:\labo | Microscope BX61 Epifluo (Caméra N/B) |
| PC : \\stocka2\bpmp‐adm‐scope2‐campus Mac : smb://stocka2/bpmp‐adm‐scope2‐campus |
LDAP | LDAP | 104 | C:\labo | Microscope BH2 lumière blanche (caméra couleur) |
| PC : \\stocka2\bpmp‐adm‐scope3‐campus Mac : smb://stocka2\bpmp‐adm‐scope3‐campus |
LDAP | LDAP | 127 | C:\labo | Loupe Olympus Fluorescente |
| PC : \\stocka2\bpmp‐adm‐scope4‐campus Mac : smb://stocka2\bpmp‐adm‐scope4‐campus |
LDAP | LDAP | 104 | C:\labo | Loupe Zeiss |
| ftp://bpmp‐adm‐scope5 | imagerie | imagerie | 107 | ||
Base équipements
Procédure / Documents
- Procédure d’accès à la plateforme PHIV – MRI La Gaillarde
- comités utilisateurs Plateforme MRI-PHIV La Gaillarde – 2019
Modes opératoires
- Toluidine Blue staining
- Technovit resin embedding
- Propidium iodide staining
- H2DCFDA
- GUS staining
- Fluorescein diacetate
- Formaldehyde glutaraldehyde fixation
- DAPI staining
- Calcofluor staining
- Perls DAB staining
- Agrobacterium infiltration
- Schiff staining