Présentation
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Directeur : Michel Rossignol Directeur de Recherche INRA Tél : 04 99 61 27 07 Mail : rossign@supagro.inra.fr |
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Secrétariat : Valérie Piazza Technicien de Recherche INRA Tél : 04 99 61 23 07 Mail : piazza@supagro.inra.fr |
Au-delà du recensement proprement dit des protéines dans un contexte physiologique donné, et au travers de démarches de protéomique post-traductionnelle et quantitative, le LPF s'intéresse plus particulièrement aux modifications réversibles et transitoires qui affectent les protéines et en déterminent la fonctionnalité.
La thématique majeure concerne la signalisation post-traductionnelle des réponses des plantes aux stress abiotiques, hors modification de l'expression du génome. L'objectif général est une compréhension intégrée des réseaux d'évènements qui aboutissent aux réponses moléculaires induites par les fluctuations de l'environnement. La plupart des projets reposent sur la caractérisation différentielle ou temporelle de statuts post-traductionnels des protéines et sont coordonnés avec des études de physiologie moléculaire conduites au travers de collaborations. Ces programmes s'appuient sur la plate-forme de spectrométrie de masse protéomique qu'anime l'unité.
Les orientations actuelles concernent tant (i) des modifications chimiques simples (phosphorylation, nitrosylation) qui affectent l'activité des protéines, leur localisation sub-cellulaire ou les interactions qu'elles développent, que (ii) des modifications plus complexes par étiquetage polypeptidique (ubiquitinylation, SUMOylation) qui en déterminent le devenir, et sont souvent en interaction avec les premières .
De manière caractéristique, les stratégies mises en œuvre sont multidisciplinaires et combinent des étapes (i) de sélection des peptides modifiés, par voie chimique, biochimique ou moléculaire, (ii) de marquage pour la quantification des états post-traductionnels, (iii) de spectrométrie de masse pour l'identification, l'analyse structurale et la quantification des peptides, et (iv) de traitement informatique et d'analyse bioinformatique pour l'exploitation de cette information.
Le LPF comprend une quinzaine de personnels, dont 10 permanents INRA et des ingénieurs ou post-doctorants sous contrat, ainsi que des doctorants et étudiants en master. L'ensemble du laboratoire est organisé en équipes-projet et est certifié ISO 9001:2008 pour son système de management de la qualité.