Les projets se proposent d'étudier l'organisation et la structure des génomes au sein et entre espèces. La cartographie comparée des génomes entre espèces agronomiques et espèces modèles, tant animales que végétales, constituera le pivot de ce thème d'animation. Ces travaux contribueront entre autres choses à l'identification de gènes d'intérêt et l'étude des échanges génétiques entre plantes cultivées et/ou sauvages (introgression, polyploïdes, hybrides). Enfin, d'autres analyses cibleront plus particulièrement certains types de séquences répétées (ADNr, éléments mobiles, motifs répétés péricentromériques et télomériques), de même que le contenu certains chromosomes (microchromosomes, chromosomes sexuels).